Limita-se ao norte com Paraty (Rio de Janeiro), ao sul com Caraguatatuba, a oeste com Cunha, São Luiz do Paraitinga e Natividade da Serra e a leste com o Oceano Atlântico. A cidade é cortada pelo Trópico de Capricórnio, que atravessa a cidade, passando em frente à pista do aeroporto local. Ubatuba é cercada pela Serra do Mar e sua exuberante Mata Atlântica. Quase oitenta por cento do território da
cidade de Ubatuba consiste em áreas de preservação. O Parque Estadual da Serra do Mar, criado para proteger e preservar a mata atlântica, tem três núcleos dentro de Ubatuba: Cunha-Indaiá, Santa Virgínia e Picinguaba. Além disso, a cidade possui uma sede do Projeto TAMAR, destinada à conservação das espécies de tartarugas-marinhas do litoral brasileiro. Encontra-se em Ubatuba uma variedade enorme de praias, segue a lista de algumas delas:
Camburi, Prainha do Camburi , Brava do Camburi ou Couves, Praiado, Picinguaba, Bicas, Fazenda, Taquara, Brava da Almada, Laço da Cavala, Engenho, Almada, Estaleiro do Padre, Ubatumirim, Justa, Surutuba, Puruba,
Meio, Prainha, Léo, Canto Itaipu, Prumirim, Conchas ou Lúcio, Félix, Prainha do Félix ou do Português, Brava de Itamambuca, Itamambuca, Alto, Vermelha do Norte, Saco da Mãe Maria, Barra Seca, Perequê-Açu, Matarazzo ou do Padre, Iperoig ou Cruzeiro, Itaguá, Prainha do Cais, Cedro ou Cedrinho, Vermelha do Centro, Tenório, Grande, Toninhas, Godoi, Itapecerica, Xandra ou Prainha do Fora, Fora, Prainha da Enseada ou Portinho, Enseada, Gerônimo ou Boa Vista, Santa Rita, Perequê-Mirim, Brava do Perequê-Mirim, Lamberto, Codó, Saco da Ribeira, Ribeira, Dionisia, Flamengo, Flamenguinho, Sete Fontes, Sununga, Lázaro, Domingas Dias, Palmira, Barra, Dura, Prainha
Brava do Sul, Vermelha do Sul, Prainha da Vermelha, Costa, Brava da Fortaleza, Fortaleza, Cedro do Sul, Prainha do Deserto, Deserto, Bonete Grande, Bonete, Peres, Oeste, Lagoinha, Sapê, Maranduba, Pulso, Caçandoca, Caçandoquinha, Raposa, Saco das Bananas, Brava do Frade ou Simão, Lagoa Mansa, Ponta Aguda, Figueira, Galhetas, e muitas outras. (Fonte: WikiPedia)